1971'de Rize'nin Ardeşen ilçesinden dünyaya gelen Mertoğlu, ilk ve orta öğrenimini Rize’de tamamladı.
1992 yılında İstanbul Üniversitesi Hukuk Fakültesi'nde lisan eğitimini tamamladıktan sonra yüksek lisans eğitimini de 2013’te Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Sosyal Bilimler Enstitüsü İşletme bölümünde aldı.
1995 yılında başladığı serbest avukatlık mesleğini 2017 yılına kadar devam ettirdi.
2000-2004 arası Rize Barosu Başkan yardımcılığı, 2004-2008 yılları arasında da Rize Barosu Başkanlığı görevini yürüten Harun Mertoğlu, 2004 ve 2016 arasında Türkiye Barolar Birliği Delegeliği yaptı.
Çok sayıda sivil toplum kuruluşunda Başkan veya üye olarak çalışmalarda bulunan Mertoğlu, Yeşilay Kurucu Şube Başkanlığı da yaptı.
Harun Mertoğlu aynı zamanda şu anda Recep Tayyip Erdoğan Üniversitesi Geliştirme Vakfı Mütevelli Heyeti'nde yer almaktadır.
2001-2015 yılları arasında aktif olarak siyasetle uğraşan Mertoğlu, Cumhurbaşkanı tarafından Türkiye İnsan Hakları ve Eşitlik Kurulu Üyeliğine seçildi ve 2023 seçimi öncesi bu görevinden istifa ederek AK Parti'den Rize milletvekili adayı oldu.
28. Dönem Milletvekilliği Genel Seçiminde AK Parti'den Rize milletvekili seçildi.
Harun Mertoğlu evli ve iki çocuk babasıdır.